Si vas a poner un sustrato comercial nutritivo, no hace falta poner arcilla.
Pero si es un sustrato casero fabricado por ti mismo, si es bueno ponerlo, principalmente como fuente de hierro y otros minerales para las plantas, debe ponerse una capa fina de 1-2 mm de espesor, debe ponerse en conjunto con otros materiales y encima la grava.
La mezcla de varios materiales suele contener gran cantidad de nutrientes, si el acuario no se planta mucho, estos nutrientes son aprovechados por algas, por eso se recomienda hacer cambios grandes -80%- de agua