por la descripción diría que es cianobacteria, pero al decir que es transparente, ya no estoy seguro de que lo sea. En cualquier caso, has hecho bien con la manera de proceder. Si notas que vuelve a salir, ya nos lo comentas por aquí y vemos que hacemos.
Y no te aconsejo que eches azul de metileno (perdón al compañero) sin saber exactamente que es. No se puede ir echando al acuario cualquier cosa así sin mas.